Esta reserva, creada en 1990, está divida en siete sectores localizados dentro de la comuna de San Pedro de Atacama. Cada sector tiene un relieve, flora, fauna e hidrografía distinto.
El sector Salar de Tara - Aguas Calientes se encuentra al este de San Pedro, a 5 horas de viaje. Aquí se encuentra el salar y laguna de Tara, el río Zapaleri, el salar de Aguas Calientes 1 y la Laguna Negra. Los animales que habitan esta área son la vicuña, zorro culpeo y la flora está compuesta por la tola de agua y amaia.
El sector Salar de Pujsa está ubicado un poco más al sur que el de Tara-Aguas Calientes, al igual que el anterior el relieve presenta planos ondulados, una depresión intermontaña y los cerros Negro de Pujsa y Balle. La fauna esta compuesta por vizcachas, chululos, flamencos, ñandúes, cóndores y aguiluchos, entre otros.
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